43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1356 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1356  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0365  flagellar assembly protein H  58.93 
 
 		 276 aa  295  6e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0342  flagellar assembly protein H  58.93 
 
 		 276 aa  293  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1643  flagellar assembly protein H  58.21 
 
 		 276 aa  291  8e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0265  flagellar assembly protein H  42.91 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  40.69 
 
 		 290 aa  185  9e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0220  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  36.33 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0474  flagellar assembly protein H  32.35 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  22.88 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.4 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  22.49 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  26.11 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  27.08 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.34 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  26.39 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.1 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  26.35 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  28.1 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  25.16 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.03 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  21.69 
 
 		 231 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  24.84 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  23.67 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  24.22 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  18.33 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  26.49 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  28.65 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  25.6 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  26.85 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  30.07 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.33 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.36 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  20.77 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  20.77 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  20.77 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  22.78 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  24.71 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  25.35 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  22.88 
 
 		 251 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>