More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1671 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  100 
 
 
338 aa  696    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  55.49 
 
 
344 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  35.12 
 
 
342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  34.82 
 
 
342 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  36.5 
 
 
318 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  32.37 
 
 
340 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  36.04 
 
 
341 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  33.83 
 
 
342 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 
339 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  32.09 
 
 
317 aa  192  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.15 
 
 
318 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  33.04 
 
 
330 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  33.96 
 
 
340 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  32.83 
 
 
331 aa  185  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  32.92 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  31.74 
 
 
590 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  33.66 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  29.67 
 
 
343 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.53 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  31.55 
 
 
332 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  31.49 
 
 
326 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  34.2 
 
 
317 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  31.02 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.27 
 
 
341 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  31.02 
 
 
339 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
348 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  30.51 
 
 
351 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.47 
 
 
334 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  29.52 
 
 
337 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  30.35 
 
 
331 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.88 
 
 
341 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  28.53 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  30.37 
 
 
365 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  28.37 
 
 
372 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  28.11 
 
 
338 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  31.33 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  30.32 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.03 
 
 
338 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.9 
 
 
338 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  30.9 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  29.74 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  30.9 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  29.74 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.53 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  30.61 
 
 
338 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  27.67 
 
 
340 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  28 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  27.98 
 
 
343 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  30.88 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  28.69 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  31.4 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  25.97 
 
 
339 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  29.88 
 
 
367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  26.43 
 
 
335 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  28.07 
 
 
359 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.67 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  28.08 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  28.98 
 
 
360 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  26.95 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  26.27 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  30.51 
 
 
314 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  28.79 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  28.57 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  28.03 
 
 
342 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  26.77 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  24.85 
 
 
319 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.06 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  26.56 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 
301 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 
324 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  29.84 
 
 
319 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  26.58 
 
 
329 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  25.54 
 
 
315 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 
322 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  26.97 
 
 
331 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  25.95 
 
 
329 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.95 
 
 
329 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.55 
 
 
317 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.95 
 
 
329 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 
301 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  25.54 
 
 
314 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  26.45 
 
 
329 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  28.3 
 
 
318 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.17 
 
 
313 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  27.12 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25 
 
 
329 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  27.83 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  27.18 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  27.67 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  25.89 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  25 
 
 
342 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  27.04 
 
 
316 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  24.36 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  24.2 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>