209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0967 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 258 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2004  ABC-2 type transporter  36.47 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.06 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  26.34 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.51 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.49 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  25.88 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.2 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  24.73 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.71 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.7 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.23 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.11 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.11 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.62 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  22.86 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  25.84 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  26.03 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  25.49 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  24.3 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  22.8 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.8 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  22.86 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.8 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  23.56 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  24.38 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  22 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3273  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, inner membrane subunit  24.69 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  23.49 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4006  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  22.8 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  24.23 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.05 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  24.34 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.2 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  24.52 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  26.64 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  26.13 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.27 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  26.13 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.15 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.15 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.77 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.14 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.09 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0291  ABC-2 type transporter  23.25 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  22.27 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>