64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4398 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  38.1 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  32.93 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  35.79 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  35.24 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  26.72 
 
 
156 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  35.05 
 
 
142 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  32.09 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  38.71 
 
 
168 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  34.43 
 
 
131 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  29.06 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  36.89 
 
 
145 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  33.33 
 
 
144 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  35.83 
 
 
126 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  35.83 
 
 
126 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  35.83 
 
 
126 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  35.83 
 
 
126 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  35.83 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  43.04 
 
 
144 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
150 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  28.57 
 
 
168 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  47.3 
 
 
143 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  42.11 
 
 
157 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  46.88 
 
 
167 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  45 
 
 
130 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  44.44 
 
 
126 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  44.44 
 
 
126 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  42.11 
 
 
122 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  43.64 
 
 
130 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  43.64 
 
 
130 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  23.91 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  41.82 
 
 
162 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  34.04 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  34.41 
 
 
126 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  35.79 
 
 
165 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  28.21 
 
 
218 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  28.21 
 
 
218 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  30.09 
 
 
112 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  28.21 
 
 
218 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  28.21 
 
 
218 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  28.21 
 
 
218 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  28.21 
 
 
218 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  26.8 
 
 
154 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  35.79 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  43.1 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  27.56 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  45.61 
 
 
132 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  38.16 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04408  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  28.83 
 
 
154 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  35.09 
 
 
102 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  38.98 
 
 
206 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  38.98 
 
 
204 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  30.48 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  40 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  40 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2310  putative lipoprotein  41.51 
 
 
102 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  40 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  27.18 
 
 
151 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  40 
 
 
216 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  33.82 
 
 
141 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  40.38 
 
 
208 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>