24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0572 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04408  hypothetical protein  49.11 
 
 		 184 aa  80.5  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  33.33 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  49.18 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  27.88 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  42.11 
 
 		 266 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  34.38 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  43.86 
 
 		 112 aa  51.2  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3568  hypothetical protein  37.29 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  44.26 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  32.43 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  42.11 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  44.44 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  40.24 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  38.1 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  45.45 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  40.24 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  45.45 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  45.45 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  45.45 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  45.45 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  38.6 
 
 		 102 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  35.63 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>