43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1904 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  83.44 
 
 
168 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  60.2 
 
 
130 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  45.64 
 
 
162 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  59.18 
 
 
130 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  59.18 
 
 
130 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  56.04 
 
 
126 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  42.96 
 
 
126 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  42.96 
 
 
126 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  50.98 
 
 
144 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  44.26 
 
 
122 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  51.96 
 
 
132 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  43.22 
 
 
131 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  65.52 
 
 
143 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  58.18 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  36 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  54.39 
 
 
116 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  34.17 
 
 
112 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  35.62 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  37.59 
 
 
141 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  45.45 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  33.83 
 
 
135 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  35.16 
 
 
134 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  34.38 
 
 
135 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  38.24 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  47.27 
 
 
108 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  39.19 
 
 
102 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  38.18 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  48.21 
 
 
176 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  40.62 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  36.67 
 
 
100 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  40.74 
 
 
96 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  43.18 
 
 
115 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  45.45 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  32.73 
 
 
131 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2310  putative lipoprotein  26.32 
 
 
102 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>