26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0540 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  36.67 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  35.34 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  54.1 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  33.05 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  31.34 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  35.09 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  35.23 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  26.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  28.87 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  40.24 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  30.17 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  30.17 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  25.83 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  26.56 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  28.91 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  31.15 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  41.27 
 
 		 176 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  28.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  28.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  28.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  28.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  28.33 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  40.8  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>