38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2721 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  206  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  85.19 
 
 
108 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  36.09 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  41.23 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  44.44 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  50 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  50 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  33.05 
 
 
115 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  33.05 
 
 
115 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  39.19 
 
 
237 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  39.19 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  39.19 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  39.19 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  39.19 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  39.68 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  49.09 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  49.09 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  49.09 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  45.45 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  42.59 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  43.1 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  40.68 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  43.1 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  45.45 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  46.15 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  46.15 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  34.29 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  46.43 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  37.5 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  40.74 
 
 
144 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  32.86 
 
 
135 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  32.35 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  48.72 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  37.84 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  47.17 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  38.6 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04408  hypothetical protein  38.03 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  36.21 
 
 
176 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>