14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04408 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04408  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  347  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  57.5 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  31.52 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  53.33 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  43.42 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  43.86 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  41.03 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  46.67 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  37.68 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  42.17 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  41.07 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  38.03 
 
 		 102 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  43.48 
 
 		 115 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>