37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1525 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  322  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  54.17 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  49.15 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  34.48 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  45.45 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  45.45 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  45.45 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  45.45 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  31.55 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  46.67 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  57.14 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  24.71 
 
 
141 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  44.64 
 
 
167 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  54.72 
 
 
122 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  36.21 
 
 
144 aa  61.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  45.45 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  44.78 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  44.83 
 
 
126 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  43.64 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  43.64 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  43.64 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  28.99 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  28.24 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  44.64 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  44.64 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  46.43 
 
 
102 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  46.43 
 
 
108 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  37.93 
 
 
126 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  37.93 
 
 
126 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  46.15 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04408  hypothetical protein  43.59 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1036  hypothetical protein  37.07 
 
 
296 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748443  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  44.07 
 
 
115 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3867  hypothetical protein  35.14 
 
 
333 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2671  hypothetical protein  34.67 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>