58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1214 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  257  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  248  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  248  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  248  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  91.34 
 
 
168 aa  223  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  60.2 
 
 
130 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  59.18 
 
 
130 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  59.18 
 
 
130 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  57.43 
 
 
162 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  56.67 
 
 
126 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  42.96 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  49.07 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  42.96 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  44.62 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  51.96 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  43.22 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  66.67 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  36 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  58.18 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  54.39 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  34.17 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  35.62 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  37.59 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  45.45 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  33.83 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  35.16 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  38.24 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  47.27 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  39.19 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  37.96 
 
 
266 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  40.62 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  48.21 
 
 
176 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  36.67 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  43.68 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  40.74 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  32.73 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  45.45 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2310  putative lipoprotein  26.32 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  28.33 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  28.33 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2494  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2293  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2386  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.920447  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2382  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.72347  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2337  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0850  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.266132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2243  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.487879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2395  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2506  lipoprotein, putative  26.32 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0591914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>