44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0815 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  47.73 
 
 		 237 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  47.73 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  47.73 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  47.73 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  47.73 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  47.01 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  48.18 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  50.47 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  50.47 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  50.47 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  58.33 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  46.39 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  43.51 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  43.51 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  40.15 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  36.18 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  50.7 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  54.55 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  35.92 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  49.18 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  37.23 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  37.41 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  36.69 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  49.12 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  35.9 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  43.24 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  39.51 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  45.16 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  33.96 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  43.1 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  50 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  41.67 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  46.55 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  38.6 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2395  hypothetical protein  37.78 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2243  hypothetical protein  37.78 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.487879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0850  hypothetical protein  37.78 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  37.78 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  37.78 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  37.78 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  37.78 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.266132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  36.54 
 
 		 96 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>