44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1694 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  100 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  99.23 
 
 		 130 aa  257  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  80 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  80 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  80.6 
 
 		 162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  80.62 
 
 		 126 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  47.76 
 
 		 237 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  47.76 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  47.76 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  47.76 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  47.76 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  46.32 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  49.23 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  40.43 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  62.71 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  40.52 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  48.74 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  55.93 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  56.9 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  50.85 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  34.4 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  30.66 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  48.21 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  33.85 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  49.09 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  49.09 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  43.64 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  28.47 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  41.07 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  28.47 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  38.98 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  37.29 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  37.29 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  28.47 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  40.35 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  45.28 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  37.65 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3875  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0857  hypothetical protein  39.24 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1799  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  38.64 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  25.42 
 
 		 102 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>