51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4581 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  57.58 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  57.14 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  57.14 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  57.43 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  57.43 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  57.43 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  56.73 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  44.62 
 
 		 237 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  44.62 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  44.62 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  44.62 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  44.62 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  43.9 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  42.15 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  43.14 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  64.29 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  35.71 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  39.09 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  38.39 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  35.88 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  36.72 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  34.4 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  36.64 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  48.08 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  54.72 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  47.46 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  47.17 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  42.59 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  46.15 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  39.58 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  40.38 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  42.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  27.27 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  44.44 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  37.04 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.266132 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2386  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.920447  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2293  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2494  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2382  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.72347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2337  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2243  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.487879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0850  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2395  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>