31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2293 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2494  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2293  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2386  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.920447  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2382  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.72347  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2337  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0850  hypothetical protein  77.27 
 
 
172 aa  174  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2395  hypothetical protein  77.27 
 
 
172 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2243  hypothetical protein  77.27 
 
 
172 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.487879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  77.27 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  77.27 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  77.27 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  76.36 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.266132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2718  hypothetical protein  64.49 
 
 
109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  34.44 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  36.92 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  36.92 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  31.87 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  37.04 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  42.31 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  35.71 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  37.25 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  37.25 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2506  lipoprotein, putative  28.42 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0591914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  27.84 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2310  putative lipoprotein  27.08 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  34.48 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>