34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0936 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0850  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  235  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2395  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  235  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2243  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  235  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.487879  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  234  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  234  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  234  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  99.11 
 
 		 112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.266132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2494  hypothetical protein  80.91 
 
 		 104 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2293  hypothetical protein  80.91 
 
 		 104 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2386  hypothetical protein  80.91 
 
 		 104 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.920447  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2382  hypothetical protein  80.91 
 
 		 104 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.72347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2337  hypothetical protein  80.91 
 
 		 104 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2718  hypothetical protein  66.07 
 
 		 109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  38.18 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  38 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  38 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  32.67 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  37.04 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2506  lipoprotein, putative  28.72 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0591914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  39.22 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  25 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  35.71 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  37.25 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  32.79 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2310  putative lipoprotein  25.26 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  37.78 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>