39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3928 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  97.92 
 
 		 96 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  87.06 
 
 		 100 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  46.59 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2310  putative lipoprotein  39.77 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2506  lipoprotein, putative  39.77 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0591914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2494  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2293  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2386  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.920447  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2382  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.72347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2337  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  36.76 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2718  hypothetical protein  31.87 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0850  hypothetical protein  38 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947239  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.266132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2395  hypothetical protein  38 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2243  hypothetical protein  38 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.487879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  38.33 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  38.33 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  38.33 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  38.33 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  37.29 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  35 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  35 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  35.59 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  38.46 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  39.62 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  36.84 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  32.89 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  32.69 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>