34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2506 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2506  lipoprotein, putative  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0591914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2310  putative lipoprotein  91.18 
 
 		 102 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  41.18 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  43.59 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  41.03 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  41.56 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  35.85 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2337  hypothetical protein  28.42 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2494  hypothetical protein  28.42 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2293  hypothetical protein  28.42 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2386  hypothetical protein  28.42 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.920447  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2382  hypothetical protein  28.42 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.72347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  27.78 
 
 		 168 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  35.09 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  28.74 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2243  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.487879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0850  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  32 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  32 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2395  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  32 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  32 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.266132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  43.14 
 
 		 266 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  29.31 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  29.31 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  26.32 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  26.32 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  26.32 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  26.32 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>