46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2345 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  83.2 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  80 
 
 		 130 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  80 
 
 		 130 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  79.23 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  74.05 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  43.48 
 
 		 237 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  48 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  45.71 
 
 		 168 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  45.16 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  36.23 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  46.55 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  34.33 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  32.84 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  36.89 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  54.24 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  57.89 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  49.15 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  37.01 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  32.28 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  32 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  29.84 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  25.68 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  46.15 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  45.61 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  37.93 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  36.67 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  36.67 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  35 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  30.17 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  30.17 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  44.44 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  37.21 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0857  hypothetical protein  33.71 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3509  hypothetical protein  26.67 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191656  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  26.72 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1799  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2506  lipoprotein, putative  29.31 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0591914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>