30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1418 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1418  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00222017  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0393  putative integral membrane protein  46.09 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  37.01 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  37.01 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  37.01 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  37.01 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  37.01 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  36.72 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  57.63 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  49.18 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  55.93 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  50.72 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  55.93 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  50.72 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  55.93 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  35.4 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  42.22 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  51.72 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  47.73 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  44.19 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  33.64 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  32.1 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  35.42 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2718  hypothetical protein  32.26 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3928  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0386372  normal  0.0405306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  36.36 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  32.35 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  27.18 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  26.89 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>