51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0069 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 141 aa  288  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  70.92 
 
 		 135 aa  203  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  72.34 
 
 		 135 aa  202  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  71.63 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  37.86 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  37.7 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  30.34 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  33.58 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  33.58 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  37.59 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  37.59 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  37.59 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  37.59 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  37.59 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  35.92 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  36.36 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  31.39 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  35.24 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  35.88 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  46.67 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  36.36 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  44.64 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  45.76 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  50 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  40.68 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  42.37 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  39.68 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  43.1 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  35.9 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  26.43 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  33.72 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  32.76 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  42 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  33.82 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  31.15 
 
 		 115 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  31.15 
 
 		 115 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.266132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2382  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.72347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2494  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2293  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2386  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.920447  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2337  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.991822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1906  hypothetical protein  37.78 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.487879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>