30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00537 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  259  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  35.61 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  38.06 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  33.33 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  36.19 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  30.71 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  36.73 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  40.68 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  29.71 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  29.77 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  26.43 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  39.34 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  33.05 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  28.68 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  28.68 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  26.4 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  26.4 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  26.4 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  26.4 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  24.43 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04408  hypothetical protein  35.11 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  29.03 
 
 		 237 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  32.73 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  25.98 
 
 		 122 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  27.27 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  34.48 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  33.93 
 
 		 167 aa  40  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>