13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0857 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0857  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  340  7e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  52.67 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0057  hypothetical protein  39.74 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3875  hypothetical protein  40.94 
 
 		 181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2514  hypothetical protein  47.54 
 
 		 212 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1799  hypothetical protein  53 
 
 		 198 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  35.71 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  37.97 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  38.75 
 
 		 130 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  38.75 
 
 		 130 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  33.71 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  33.71 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  27.64 
 
 		 171 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>