50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3132 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 530 aa  1080    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  41.48 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  37.94 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  36.55 
 
 		 477 aa  299  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  33.73 
 
 		 503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.27 
 
 		 509 aa  279  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.27 
 
 		 510 aa  279  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  39.66 
 
 		 388 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  37.69 
 
 		 501 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  33.54 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.71 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.95 
 
 		 512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  34.59 
 
 		 544 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.14 
 
 		 514 aa  263  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  31.53 
 
 		 548 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.54 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.69 
 
 		 519 aa  246  9e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.93 
 
 		 550 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.18 
 
 		 611 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  26.73 
 
 		 578 aa  143  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  28.02 
 
 		 576 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  25.59 
 
 		 561 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  24.2 
 
 		 557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  24.43 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  25.17 
 
 		 566 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  33.11 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3601  hypothetical protein  27.78 
 
 		 465 aa  57  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  30.77 
 
 		 755 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1931  hypothetical protein  23.22 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00823138  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.07 
 
 		 1276 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  23.23 
 
 		 369 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.94 
 
 		 415 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  28.69 
 
 		 748 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  23.86 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1927  hypothetical protein  26.48 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.177201 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 686 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 686 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  29.25 
 
 		 659 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  29.25 
 
 		 658 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  24.32 
 
 		 602 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.11 
 
 		 604 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  30 
 
 		 772 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  24.9 
 
 		 760 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  25.47 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  17.78 
 
 		 745 aa  43.9  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  17.78 
 
 		 745 aa  43.9  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  23.91 
 
 		 450 aa  43.5  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>