126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2406 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  59.85 
 
 
526 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  100 
 
 
514 aa  1058    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  58.25 
 
 
524 aa  633  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  57.5 
 
 
517 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  58.94 
 
 
524 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  58.78 
 
 
522 aa  618  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  55.56 
 
 
508 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  53.54 
 
 
537 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  49.32 
 
 
514 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  51.06 
 
 
520 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  48.28 
 
 
525 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  51.13 
 
 
531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  47.47 
 
 
543 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  47.84 
 
 
543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  47.57 
 
 
543 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  47.39 
 
 
543 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  49.41 
 
 
527 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  47.83 
 
 
528 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  47.5 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  45.09 
 
 
517 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  45.99 
 
 
524 aa  468  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  48.55 
 
 
505 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  46.5 
 
 
532 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  46.97 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  45.26 
 
 
524 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  44.29 
 
 
520 aa  445  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  44.1 
 
 
513 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  43.91 
 
 
513 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  44.1 
 
 
513 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  43.5 
 
 
507 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  43.36 
 
 
508 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  42.41 
 
 
507 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  42.69 
 
 
507 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  42.83 
 
 
508 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  43.41 
 
 
522 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  42.55 
 
 
508 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  42.33 
 
 
507 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  40.37 
 
 
537 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  41.34 
 
 
515 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  41.99 
 
 
511 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  40 
 
 
507 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  42.12 
 
 
510 aa  365  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  36.09 
 
 
517 aa  276  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.74 
 
 
498 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.84 
 
 
505 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  35.66 
 
 
492 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.62 
 
 
508 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
508 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.98 
 
 
502 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  31.77 
 
 
538 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  34.5 
 
 
501 aa  247  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
529 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.46 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  36.03 
 
 
501 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  32.29 
 
 
529 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.88 
 
 
499 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  31.7 
 
 
538 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  31.7 
 
 
538 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.47 
 
 
499 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.47 
 
 
499 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.31 
 
 
495 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  34.18 
 
 
498 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.95 
 
 
504 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  32.69 
 
 
500 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  30.68 
 
 
538 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  30.68 
 
 
538 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  30.68 
 
 
538 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.89 
 
 
506 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  31.77 
 
 
537 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  34.93 
 
 
515 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  32.18 
 
 
507 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  36.36 
 
 
497 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.58 
 
 
505 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.81 
 
 
502 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.33 
 
 
506 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
503 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
501 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  32.44 
 
 
503 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  34.53 
 
 
497 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.2 
 
 
503 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  33.2 
 
 
503 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  32.57 
 
 
501 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  33.97 
 
 
500 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  33.01 
 
 
503 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  32.57 
 
 
511 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  35.06 
 
 
512 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  35.29 
 
 
509 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.88 
 
 
510 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  34.26 
 
 
504 aa  228  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  35.2 
 
 
504 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.85 
 
 
502 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  34.77 
 
 
503 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  33.21 
 
 
509 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  32.08 
 
 
499 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  32.61 
 
 
496 aa  223  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.92 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  34.4 
 
 
507 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  32.56 
 
 
505 aa  221  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  35.42 
 
 
505 aa  220  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>