More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1629 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  61.02 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  59.66 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  60.23 
 
 		 180 aa  214  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  59.43 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  59.09 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  58.29 
 
 		 180 aa  211  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  58.52 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  57.39 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  57.39 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  207  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  56 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 178 aa  204  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  204  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  202  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  202  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  202  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  57.14 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  201  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  200  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  53.22 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  53.8 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  55.68 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 178 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.14 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  197  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 178 aa  197  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 178 aa  197  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 178 aa  197  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  54.55 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  53.14 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  55.11 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  54.24 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50.88 
 
 		 182 aa  191  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>