42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1646 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  100 
 
 
770 aa  1573    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  59.4 
 
 
777 aa  929    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  68.48 
 
 
773 aa  1048    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  69.66 
 
 
774 aa  1061    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 
586 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  27.05 
 
 
943 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  27.8 
 
 
251 aa  63.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  26.53 
 
 
931 aa  62.4  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  27.72 
 
 
929 aa  62  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  25.72 
 
 
955 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 
208 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  25.47 
 
 
894 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  25.47 
 
 
894 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  26.23 
 
 
896 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
484 aa  52.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 
218 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 
463 aa  52  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 
467 aa  51.6  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.92 
 
 
462 aa  51.6  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 
430 aa  51.2  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 
455 aa  51.2  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 
433 aa  50.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.77 
 
 
485 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 
481 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 
412 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 
396 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  30.7 
 
 
288 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  25 
 
 
241 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  26.45 
 
 
895 aa  48.1  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  29.82 
 
 
280 aa  48.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 
620 aa  47.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  26.59 
 
 
486 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  25.39 
 
 
909 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 
477 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 
433 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 
160 aa  45.8  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 
455 aa  45.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  37.88 
 
 
294 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  33.82 
 
 
284 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 
389 aa  44.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  28.36 
 
 
286 aa  44.3  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  30 
 
 
448 aa  44.3  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>