53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0331 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0331  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0231643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  72.44 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0766  DNA polymerase beta subunit  69.47 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1471  DNA polymerase beta domain protein region  70.23 
 
 		 139 aa  185  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.764189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1972  DNA polymerase beta domain protein region  53.54 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1816  hypothetical protein  51.97 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000972669  normal  0.858588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2332  DNA polymerase beta subunit  48.82 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  43.33 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0755  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  41.09 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0133  DNA polymerase beta subunit  39.53 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  32.93 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  30.51 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  32.48 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3941  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2345  DNA polymerase beta domain protein region  29.03 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2946  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  30.68 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  33.78 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  30.34 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1313  hypothetical protein  33.73 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  31.53 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0893  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.75 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  32.29 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  32.89 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  33.04 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  30.67 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0217  hypothetical protein  27.36 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  31.46 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  31.5 
 
 		 152 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  39.66 
 
 		 97 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  29.17 
 
 		 146 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  32.1 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  31.94 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  30.49 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  34.38 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  31.97 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  28.35 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2734  DNA polymerase beta domain protein region  28.91 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 97 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>