More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6964 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  100 
 
 		 399 aa  795    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  51.24 
 
 		 462 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  48.56 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.58 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  38.94 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 441 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.57 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  39.06 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  36.94 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.34 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.78 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.24 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.08 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  38.28 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.23 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  40.15 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  38.04 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.76 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.83 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  35.51 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  33.16 
 
 		 380 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  42.39 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  34.48 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  37.45 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.15 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.51 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.33 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  38.13 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.97 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  38.24 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  40.39 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  37.89 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.03 
 
 		 370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.7 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  38.85 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  37.79 
 
 		 357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  36.19 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.93 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 421 aa  133  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  32.49 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 500 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.94 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  34.73 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.02 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  38.22 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  33.94 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  37.37 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.73 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  34.23 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.36 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  34.04 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  35.77 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  34.59 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  29.73 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.77 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.91 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  31.94 
 
 		 390 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  36.36 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.2 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  38.3 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.25 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  32.7 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35.71 
 
 		 408 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  40 
 
 		 434 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  29.75 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0325  putative two-component system sensor kinase  30.71 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.54 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  35.51 
 
 		 291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  33.43 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  34.1 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  36.44 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  36.44 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  32.84 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.88 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  37.22 
 
 		 387 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  36.86 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  30.12 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.35 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  35.63 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>