More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4902 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 501 aa  1009    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  57.43 
 
 		 503 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  54.37 
 
 		 509 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  50.57 
 
 		 529 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  46.59 
 
 		 499 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  45.92 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  46.23 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  45.34 
 
 		 508 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  44.64 
 
 		 516 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  43.81 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  43.44 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  37.9 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  37.9 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  38.16 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  43.5 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  43.5 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  43.5 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  37.7 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  44.65 
 
 		 620 aa  362  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 		 513 aa  353  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  42.38 
 
 		 512 aa  350  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  41.76 
 
 		 515 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 496 aa  336  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  40.99 
 
 		 501 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 		 491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 525 aa  329  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 554 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  40.91 
 
 		 520 aa  325  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 		 527 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  41.65 
 
 		 528 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 1043 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  39.32 
 
 		 503 aa  319  7e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 		 517 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 		 526 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 		 518 aa  309  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.52 
 
 		 533 aa  307  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  39.25 
 
 		 516 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 		 530 aa  302  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.66 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  39.96 
 
 		 490 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 521 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 		 518 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.69 
 
 		 525 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 520 aa  299  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 526 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  39.13 
 
 		 532 aa  298  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  38.69 
 
 		 536 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 518 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 518 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 518 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  38.02 
 
 		 531 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 		 511 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 512 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  39.33 
 
 		 536 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  36.57 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 		 502 aa  294  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 530 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 		 517 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.02 
 
 		 556 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 662 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  38.95 
 
 		 516 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  38.45 
 
 		 532 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.02 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.02 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 520 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 490 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 517 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.11 
 
 		 525 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 518 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.8 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.65 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 519 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  36.78 
 
 		 545 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.79 
 
 		 579 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 		 502 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  36.25 
 
 		 522 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  38.59 
 
 		 506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  38.9 
 
 		 506 aa  290  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 520 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  37.85 
 
 		 556 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.59 
 
 		 492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  38.72 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 502 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 527 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  37.72 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.04 
 
 		 524 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>