More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3233 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3771  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.53 
 
 		 614 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.36 
 
 		 736 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3233  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 638 aa  1290    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.59 
 
 		 726 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  53.97 
 
 		 1224 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  53.87 
 
 		 727 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  54.28 
 
 		 749 aa  634  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  54.59 
 
 		 785 aa  631  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.72 
 
 		 957 aa  630  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  52.47 
 
 		 731 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  57.53 
 
 		 755 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.2 
 
 		 743 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  52.06 
 
 		 759 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  53.18 
 
 		 1240 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  51.73 
 
 		 759 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  53.81 
 
 		 748 aa  617  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  51.73 
 
 		 759 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  53.67 
 
 		 812 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  51.61 
 
 		 741 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  51.07 
 
 		 737 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.3 
 
 		 839 aa  608  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.55 
 
 		 732 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.92 
 
 		 746 aa  611  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.78 
 
 		 743 aa  601  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.13 
 
 		 822 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  53.58 
 
 		 732 aa  600  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.16 
 
 		 754 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  52.31 
 
 		 776 aa  597  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  51.79 
 
 		 1320 aa  591  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.33 
 
 		 741 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  51.73 
 
 		 749 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.59 
 
 		 734 aa  584  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  47.71 
 
 		 750 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.85 
 
 		 741 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.01 
 
 		 731 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.51 
 
 		 739 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.97 
 
 		 761 aa  553  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 732 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  48.76 
 
 		 728 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  48.6 
 
 		 728 aa  545  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.28 
 
 		 631 aa  544  1e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 		 722 aa  544  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  50.34 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  46.54 
 
 		 726 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  48.1 
 
 		 728 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  47.97 
 
 		 677 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  46.15 
 
 		 735 aa  535  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  46 
 
 		 735 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  46.91 
 
 		 736 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  47.62 
 
 		 740 aa  532  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.62 
 
 		 735 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.9 
 
 		 631 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  46.74 
 
 		 736 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  46.58 
 
 		 736 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.9 
 
 		 785 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  49.26 
 
 		 732 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.06 
 
 		 784 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  46.63 
 
 		 736 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.06 
 
 		 784 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.62 
 
 		 732 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.65 
 
 		 635 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  49.75 
 
 		 750 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  46.82 
 
 		 738 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.41 
 
 		 770 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.39 
 
 		 1217 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  46.73 
 
 		 735 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  48.16 
 
 		 768 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  48.16 
 
 		 768 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.78 
 
 		 621 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  47.81 
 
 		 733 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  48.17 
 
 		 677 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  48.68 
 
 		 725 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  48.29 
 
 		 642 aa  525  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  47.53 
 
 		 748 aa  524  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  47.75 
 
 		 721 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  47.08 
 
 		 736 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  49.42 
 
 		 736 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  49.25 
 
 		 736 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  46.58 
 
 		 736 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  46.06 
 
 		 743 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  46.23 
 
 		 743 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  45.77 
 
 		 746 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  49.42 
 
 		 738 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  49.17 
 
 		 735 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  46.06 
 
 		 743 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  45.9 
 
 		 745 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  49.42 
 
 		 738 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  49.91 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  45.9 
 
 		 743 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  49.42 
 
 		 738 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  47.65 
 
 		 732 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  45.87 
 
 		 744 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  49.25 
 
 		 736 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  48.08 
 
 		 775 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  49.22 
 
 		 740 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  46.69 
 
 		 625 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.52 
 
 		 728 aa  518  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  49.59 
 
 		 695 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  49.17 
 
 		 733 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  47.32 
 
 		 732 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>