More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4398 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  37.81 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  37.14 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  34.56 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  34.94 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  34.06 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  33.79 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 		 407 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 		 286 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30.73 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  30.04 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.95 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 412 aa  113  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 455 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 408 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  29.03 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.11 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  29.84 
 
 		 415 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  28.51 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03213  hypothetical protein  32.9 
 
 		 161 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000858892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  28.74 
 
 		 422 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  30.57 
 
 		 373 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  29.03 
 
 		 517 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.75 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  29.47 
 
 		 505 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  25.97 
 
 		 456 aa  89.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  30.06 
 
 		 274 aa  89  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.85 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 467 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  30.64 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  28.82 
 
 		 467 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 467 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.61 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  26.51 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  25.58 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.72 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  31.4 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.43 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  29.32 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.86 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.89 
 
 		 634 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  28.64 
 
 		 790 aa  82.4  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  27.15 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  30.81 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  28.75 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  25.49 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  25.5 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  26.04 
 
 		 650 aa  79  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  27.01 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  26.69 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  21.05 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  26.07 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  27.53 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  28.49 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  23.58 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  27.81 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  27.18 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  27.96 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.91 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  22.41 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  27.37 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.89 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  24.46 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  26.17 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  22.93 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  20.91 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  29.35 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>