254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3465 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 		 443 aa  875    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  54.88 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  55.24 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  54.42 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  54.65 
 
 		 445 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  54.65 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  55.37 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  55.92 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  55.37 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  55.01 
 
 		 443 aa  438  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  55.37 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  56.46 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  52.96 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  52.57 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  52.97 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  53.2 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  54.32 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  53.85 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  53.45 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  53.53 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  52.74 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  50.24 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  46.08 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  46.96 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  47.8 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  43.18 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  49.75 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  46.93 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  43.47 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  43.84 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  43.84 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  43.84 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  43.84 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  43.84 
 
 		 438 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  46.27 
 
 		 468 aa  333  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  43.47 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  43.47 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  42.89 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  43.36 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  43.36 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  44.96 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  41.27 
 
 		 459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  41.27 
 
 		 459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  42.31 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  41.26 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  43.77 
 
 		 431 aa  294  3e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  43.06 
 
 		 441 aa  292  7e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  36.95 
 
 		 439 aa  279  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  39.29 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  39.29 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  36.84 
 
 		 431 aa  276  8e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  38.38 
 
 		 423 aa  266  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  37.3 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  36.79 
 
 		 425 aa  249  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  39.13 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  36.45 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  35.42 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  33.42 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  28.93 
 
 		 473 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.4 
 
 		 467 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  24.77 
 
 		 470 aa  87  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  24.77 
 
 		 483 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  24.54 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  25.41 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  30.43 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  26.32 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.89 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  29.3 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  26.2 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  38.56 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  24.02 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  37.58 
 
 		 507 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  25.64 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  25.64 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  24.45 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  24.78 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  26.78 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  25.95 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  29 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.17 
 
 		 567 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  25.7 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  26.09 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  28.47 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  26.23 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  26 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  35.58 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  22.41 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.17 
 
 		 564 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  23.6 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  28.78 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  23.08 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  23.79 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.49 
 
 		 567 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2417  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.56 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  23.47 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  23.47 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  23.6 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  23.79 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  33.72 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  23.79 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>