More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1324 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  802    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241665  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  30.61 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  28.83 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 423 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  30.31 
 
 		 430 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 436 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 415 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  26.03 
 
 		 426 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  28.33 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.62 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.2 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.08 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3270  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  26.19 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 405 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.14 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.85 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  27.85 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.99 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.15 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  29.72 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 453 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  25.91 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.06 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  27.09 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  28.76 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>