125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1023 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  100 
 
 		 518 aa  1085    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  47.5 
 
 		 514 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  48.65 
 
 		 524 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  47.44 
 
 		 524 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  46.93 
 
 		 537 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  46.62 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  47.9 
 
 		 517 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  47.69 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  46.15 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  45.35 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  44.4 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  45.35 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  43.71 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  45.16 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  45.37 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  44.61 
 
 		 543 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  43.87 
 
 		 543 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  43.49 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  43.31 
 
 		 543 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  42.83 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  45.31 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  44.1 
 
 		 508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  43.5 
 
 		 531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  42.94 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  43.38 
 
 		 517 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  42.28 
 
 		 514 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  40.86 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  44.1 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  42.48 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  42.33 
 
 		 508 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  43.35 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  41.17 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  41.36 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  40.08 
 
 		 522 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  40.97 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  39.54 
 
 		 507 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  38.42 
 
 		 507 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  40.17 
 
 		 507 aa  353  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  38.43 
 
 		 511 aa  346  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  38.63 
 
 		 510 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  34.87 
 
 		 537 aa  339  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  40.43 
 
 		 515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  32.32 
 
 		 538 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  32.13 
 
 		 538 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  31.95 
 
 		 538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  35.12 
 
 		 508 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  35.33 
 
 		 508 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  35.12 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  31.25 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  31.25 
 
 		 538 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.92 
 
 		 498 aa  263  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 529 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  30.87 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  33.19 
 
 		 529 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  36.26 
 
 		 517 aa  259  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  32.08 
 
 		 537 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.97 
 
 		 501 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  35.44 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 499 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  33.19 
 
 		 501 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  35.82 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  35.42 
 
 		 507 aa  253  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  34.9 
 
 		 492 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  35.29 
 
 		 512 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  35.03 
 
 		 504 aa  246  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.15 
 
 		 497 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  35.16 
 
 		 501 aa  243  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  34.33 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  36.03 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  33.69 
 
 		 497 aa  240  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 505 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  31.54 
 
 		 500 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  32.63 
 
 		 506 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  35.08 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 505 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  32.24 
 
 		 503 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  34.39 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  32.7 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.1 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  36.05 
 
 		 740 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  32.97 
 
 		 501 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  32.09 
 
 		 499 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  33.97 
 
 		 496 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  33.72 
 
 		 515 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  34.24 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 495 aa  230  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  34.46 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  35.18 
 
 		 503 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  34.74 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  32.02 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 506 aa  226  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  31.18 
 
 		 518 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 503 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 503 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 505 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  30.35 
 
 		 505 aa  226  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  31.65 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>