More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0119 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  38.3 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  39.01 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  33.8 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 146 aa  95.9  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 193 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 193 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 295 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  32.33 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  27.66 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 158 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  26.36 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  32.12 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  26.28 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>