More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0870 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
85 aa  167  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  63.29 
 
 
89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  59.21 
 
 
90 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  59.21 
 
 
90 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  59.21 
 
 
90 aa  105  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  59.21 
 
 
90 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  55.29 
 
 
114 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
96 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  56.58 
 
 
90 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  49.41 
 
 
125 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  53.09 
 
 
99 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
94 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  51.81 
 
 
97 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
99 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  51.22 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
96 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  50 
 
 
102 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  43.9 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  42.5 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  52.31 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  35.8 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
118 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  35.53 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  33.33 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  35.62 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  32.5 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>