More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2322 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 592 aa  1193    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  98.48 
 
 		 592 aa  1180    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.22 
 
 		 576 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_0876  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.22 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0250964  n/a   
 
 
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NC_013171  Apre_0909  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.83 
 
 		 576 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.82 
 
 		 785 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.13 
 
 		 811 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.92 
 
 		 572 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.22 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.22 
 
 		 779 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.22 
 
 		 779 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  38.31 
 
 		 779 aa  363  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  38.12 
 
 		 779 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.12 
 
 		 779 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.12 
 
 		 779 aa  363  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 572 aa  363  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.12 
 
 		 779 aa  362  9e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.74 
 
 		 827 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.85 
 
 		 779 aa  362  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.85 
 
 		 779 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.85 
 
 		 779 aa  362  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.34 
 
 		 885 aa  360  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.04 
 
 		 573 aa  356  6.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  37.09 
 
 		 932 aa  355  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 584 aa  353  2.9999999999999997e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.41 
 
 		 788 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 989 aa  352  7e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.5 
 
 		 578 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.35 
 
 		 907 aa  350  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.07 
 
 		 814 aa  349  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.48 
 
 		 864 aa  346  7e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.14 
 
 		 801 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.24 
 
 		 732 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.57 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  33.73 
 
 		 574 aa  338  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.14 
 
 		 564 aa  337  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.72 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 977 aa  337  5e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  34.22 
 
 		 578 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.96 
 
 		 568 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.67 
 
 		 584 aa  333  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 573 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  35.06 
 
 		 566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.23 
 
 		 883 aa  325  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.94 
 
 		 798 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.4 
 
 		 831 aa  323  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.92 
 
 		 756 aa  321  3e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.71 
 
 		 570 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.72 
 
 		 568 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.72 
 
 		 599 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.36 
 
 		 574 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 742 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.89 
 
 		 571 aa  313  7.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.56 
 
 		 579 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.07 
 
 		 757 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.07 
 
 		 757 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.92 
 
 		 570 aa  310  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.18 
 
 		 583 aa  309  9e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  32.27 
 
 		 568 aa  309  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.59 
 
 		 568 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.57 
 
 		 566 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 865 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.58 
 
 		 566 aa  306  7e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  32.91 
 
 		 701 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  33.15 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.42 
 
 		 655 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  31.74 
 
 		 592 aa  303  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.11 
 
 		 757 aa  303  6.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.68 
 
 		 568 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  35.28 
 
 		 736 aa  302  9e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.99 
 
 		 574 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.78 
 
 		 654 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 655 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 655 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.09 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.6 
 
 		 564 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.15 
 
 		 573 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.15 
 
 		 573 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36 
 
 		 1035 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 569 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.75 
 
 		 622 aa  295  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.71 
 
 		 573 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.98 
 
 		 574 aa  294  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.17 
 
 		 567 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.9 
 
 		 566 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  31.07 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.6 
 
 		 857 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 955 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0848  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.56 
 
 		 559 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3601e-16 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.53 
 
 		 955 aa  290  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.43 
 
 		 763 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2372  exonuclease RecJ  30.47 
 
 		 730 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.945407  normal  0.30551 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  30.38 
 
 		 684 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.66 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0844  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.99 
 
 		 559 aa  286  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.13 
 
 		 560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.65 
 
 		 813 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.78 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.54 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3773  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.33 
 
 		 785 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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