183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0995 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  90.32 
 
 
165 aa  279  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  50.29 
 
 
184 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.11 
 
 
185 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  40.46 
 
 
189 aa  164  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  41.27 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.62 
 
 
186 aa  157  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  38.38 
 
 
186 aa  152  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
186 aa  147  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.25 
 
 
186 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.11 
 
 
215 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  32.11 
 
 
200 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.53 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.87 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  35 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.49 
 
 
194 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.44 
 
 
190 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.26 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  30.32 
 
 
190 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  32.63 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  31.49 
 
 
190 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  32 
 
 
189 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.85 
 
 
195 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  31.84 
 
 
189 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  28.49 
 
 
189 aa  101  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  29.05 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  29.05 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.42 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 
190 aa  95.5  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  30.73 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.67 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.78 
 
 
209 aa  91.3  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  26.2 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.32 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  27.57 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.43 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.06 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.47 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  28.92 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  28.92 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.67 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.12 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.57 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  30.41 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.23 
 
 
186 aa  61.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  24.85 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  25 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.14 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.52 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  27.27 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  23.89 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.87 
 
 
221 aa  58.9  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.66 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  21.88 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  23.64 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.69 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  25.37 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  32.82 
 
 
180 aa  57.8  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.3 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.32 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  31.34 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  26.86 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  33.06 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  26.92 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.13 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  23.3 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  25.76 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.39 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  27.21 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  35.19 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  33.75 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
180 aa  55.1  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  20.45 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.63 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  23.12 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  22.7 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.85 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  29.13 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  24.32 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.46 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.46 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  20.69 
 
 
202 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.69 
 
 
180 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.96 
 
 
196 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  20.83 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  22.6 
 
 
220 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.81 
 
 
159 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  22.83 
 
 
248 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  20.38 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  22.11 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.69 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  27.41 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  25.14 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.08 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.6 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.2 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0881  hypothetical protein  95.65 
 
 
29 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00931729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  27.2 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  20.71 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>