More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ03280 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ03280  tRNA methyltransferase, putative  100 
 
 		 613 aa  1268    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00141  tRNA methyltransferase (Eurofung)  35.78 
 
 		 575 aa  316  7e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51919  tRNA(m5U54)methyltransferase  36.22 
 
 		 560 aa  313  4.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00837808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  35.12 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0855  RNA methyltransferase  36.88 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50774  RNA methyltransferase tRNA(m5U54)methyltransferase  33.13 
 
 		 542 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.2179 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  32.61 
 
 		 378 aa  235  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  26.85 
 
 		 453 aa  144  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  26.85 
 
 		 453 aa  144  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  26.54 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  26.32 
 
 		 456 aa  141  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  26.05 
 
 		 459 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  26.05 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  26.05 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  26.55 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.2 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  26.01 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  26.01 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.01 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.01 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  27.57 
 
 		 446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  25.82 
 
 		 459 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  26.78 
 
 		 488 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  28.51 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  27.18 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  27.07 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  27.04 
 
 		 470 aa  130  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  26.87 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  27.11 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  27.2 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  26.12 
 
 		 481 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  25.62 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  26.91 
 
 		 458 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  26.91 
 
 		 458 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  26.91 
 
 		 458 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.9 
 
 		 455 aa  128  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  25.05 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  27 
 
 		 454 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  26.43 
 
 		 478 aa  127  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  23.37 
 
 		 446 aa  127  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  27 
 
 		 454 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  26.75 
 
 		 460 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  26.71 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  26.71 
 
 		 458 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  28.69 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  26.15 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  27.29 
 
 		 460 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  25.52 
 
 		 480 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  26.26 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  27.13 
 
 		 434 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.81 
 
 		 485 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  25.5 
 
 		 470 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  25.38 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  28.06 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  26.29 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  24.44 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  26.38 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  24.9 
 
 		 457 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.75 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  25.75 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  26.6 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  27.78 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  25.7 
 
 		 485 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  36.45 
 
 		 457 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  25.88 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  26.52 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  25.88 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  24.62 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  36.87 
 
 		 459 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  25.79 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  25.54 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  26.21 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  25.62 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  25.2 
 
 		 495 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  27.15 
 
 		 465 aa  113  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  27.46 
 
 		 438 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  25.95 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  26.97 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  24.94 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  25.34 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  27.02 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  24.24 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  33.95 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  25.72 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.72 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  34.72 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  35.29 
 
 		 454 aa  109  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  27.88 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  23.81 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  22.35 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  24.49 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  27.52 
 
 		 465 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  26.88 
 
 		 468 aa  107  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  23.7 
 
 		 397 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  25.2 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  25.19 
 
 		 455 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  23.18 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  23.91 
 
 		 439 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  24.36 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  24.29 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>