251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04680 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC04680  threonine aldolase, putative  100 
 
 
458 aa  945    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71203  threonine aldolase  43.37 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200501  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74130  threonine aldolase  44.12 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07564  threonine aldolase or alanine racemase, putative (Eurofung)  42.07 
 
 
411 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.10201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  38.24 
 
 
340 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.33 
 
 
345 aa  202  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  39.8 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  36.57 
 
 
334 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  37.79 
 
 
338 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  34.55 
 
 
356 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  35.28 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  35.31 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  36.96 
 
 
334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  38.51 
 
 
334 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  35.31 
 
 
351 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  39.87 
 
 
343 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  35.31 
 
 
339 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  39.86 
 
 
337 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  40.67 
 
 
344 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  36.92 
 
 
337 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  36.39 
 
 
334 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  36.41 
 
 
343 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  37.18 
 
 
334 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.61 
 
 
344 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  36.29 
 
 
334 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  35.65 
 
 
461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  34.28 
 
 
368 aa  190  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  34.4 
 
 
333 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  35.51 
 
 
337 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  35.51 
 
 
337 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  34.07 
 
 
340 aa  189  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  40.4 
 
 
343 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  40.92 
 
 
344 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05426  threonine aldolase, putative (Eurofung)  35.12 
 
 
328 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142364  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  36.23 
 
 
337 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  37.16 
 
 
333 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  35.49 
 
 
341 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  34.94 
 
 
337 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  38.38 
 
 
337 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  35.77 
 
 
343 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  37.62 
 
 
333 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  38.54 
 
 
370 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  35.77 
 
 
343 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  38.51 
 
 
337 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  38.21 
 
 
339 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  35.65 
 
 
337 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  35.65 
 
 
337 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  35.65 
 
 
337 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  35.47 
 
 
337 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  35.17 
 
 
337 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  38.51 
 
 
337 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  35.65 
 
 
337 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  35.65 
 
 
458 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  38.98 
 
 
345 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  35.92 
 
 
334 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  35.65 
 
 
397 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  35.65 
 
 
397 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  36.82 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  36.82 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  36.82 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  36.82 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  35.88 
 
 
336 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  36.82 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  34.78 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  35.23 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  38.51 
 
 
337 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  36.34 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  36.82 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  38.18 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  36.82 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  35.47 
 
 
337 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  38.18 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  34.78 
 
 
333 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  34.78 
 
 
333 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  38.05 
 
 
337 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  38.22 
 
 
337 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  35.47 
 
 
337 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  34.78 
 
 
333 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  42.71 
 
 
352 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  34.78 
 
 
333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3651  threonine aldolase  42.71 
 
 
349 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  36.69 
 
 
339 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  40.2 
 
 
367 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  37.71 
 
 
337 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  36.93 
 
 
336 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  36.6 
 
 
343 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  36.39 
 
 
338 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  39.43 
 
 
359 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  38.51 
 
 
337 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  36.87 
 
 
344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  37.54 
 
 
357 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  37.43 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  35.23 
 
 
334 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  36.16 
 
 
359 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  39.33 
 
 
343 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  36.78 
 
 
348 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  34.97 
 
 
336 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  38.46 
 
 
337 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  34.94 
 
 
334 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  35.17 
 
 
335 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>