135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1727 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1727  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.51 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  44.96 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  43.41 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  44.54 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  46.09 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2020  cupin 2, barrel  48.7 
 
 		 178 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0745737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.97 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  44.53 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  46.09 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  41.54 
 
 		 276 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  39.53 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  44.09 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  45.69 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.64 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  41.91 
 
 		 387 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  41.54 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  43.55 
 
 		 298 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.54 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.02 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  41.41 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  43.44 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  40.48 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.09 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.6 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.6 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.51 
 
 		 219 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.46 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.48 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  39.84 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  39.23 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.73 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  41.41 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  41.41 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  48.54 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  38.93 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  40.31 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.21 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.09 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 179 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  37.98 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.98 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  39.69 
 
 		 170 aa  93.6  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.69 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  34.33 
 
 		 396 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  39.84 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  39.53 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  39.53 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  40.8 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  38.14 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.17 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  37.8 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.83 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 		 132 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  39.2 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.17 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  40.5 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  37.98 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.34 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  39.83 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  35.56 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  32.58 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  34.11 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  40.35 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  39.47 
 
 		 403 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  32.81 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  34.68 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.34 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  38.66 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.82 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  36.75 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  36.61 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  38.66 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.11 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  35.83 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>