63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3119 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3119  phytase  100 
 
 		 998 aa  2032    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  53.46 
 
 		 686 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  33.76 
 
 		 438 aa  185  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  33.58 
 
 		 429 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  33.51 
 
 		 1844 aa  151  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  29.74 
 
 		 470 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  32.04 
 
 		 451 aa  144  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  29.97 
 
 		 453 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  29.89 
 
 		 453 aa  140  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  30.59 
 
 		 451 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  29.43 
 
 		 454 aa  136  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  28.11 
 
 		 457 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.59 
 
 		 438 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  27.8 
 
 		 513 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  26.72 
 
 		 472 aa  126  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  27.8 
 
 		 513 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  27.8 
 
 		 513 aa  126  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  27.8 
 
 		 513 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  27.96 
 
 		 699 aa  124  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  29.52 
 
 		 512 aa  122  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  30.62 
 
 		 1175 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  26.7 
 
 		 461 aa  117  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  27.4 
 
 		 456 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  28.27 
 
 		 526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  27.27 
 
 		 510 aa  97.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  31.9 
 
 		 501 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  31.54 
 
 		 501 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  24.66 
 
 		 2852 aa  92  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  30.5 
 
 		 494 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1977  protein of unknown function DUF1555  26.21 
 
 		 577 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2004  protein of unknown function DUF1555  26.21 
 
 		 577 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.16 
 
 		 3977 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0563  protein of unknown function DUF839  26.02 
 
 		 489 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.267777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2382  hypothetical protein  26 
 
 		 498 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  29.74 
 
 		 945 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  24.68 
 
 		 854 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2679  protein of unknown function DUF839  25.19 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2478  hypothetical protein  27.88 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0296933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  20.96 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  25.72 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 		 1016 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  24.55 
 
 		 487 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  27.57 
 
 		 504 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  23.21 
 
 		 390 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  27.11 
 
 		 469 aa  52  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  36.26 
 
 		 540 aa  51.2  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4162  protein of unknown function DUF839  25.67 
 
 		 504 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0755591  normal  0.0467727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  26.19 
 
 		 388 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  31.88 
 
 		 748 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  24.9 
 
 		 515 aa  48.9  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1969 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  30 
 
 		 1010 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  24.26 
 
 		 495 aa  47.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  30.19 
 
 		 554 aa  45.8  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  22.59 
 
 		 384 aa  45.8  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  28.36 
 
 		 887 aa  45.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  25.28 
 
 		 760 aa  45.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  23.13 
 
 		 457 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  36.51 
 
 		 685 aa  44.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  23.83 
 
 		 495 aa  44.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>