30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2947 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  714    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 1687 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  34.06 
 
 		 1672 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  32.8 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 208 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 498 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 223 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 455 aa  49.7  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 545 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 138 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 433 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  31.1 
 
 		 207 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 480 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  22.31 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  22.96 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0008  divergent AAA region  31.58 
 
 		 412 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  31.13 
 
 		 429 aa  43.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 422 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 230 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.2 
 
 		 412 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>