More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1357 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1357  protease  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  70.96 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  69.06 
 
 		 308 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  68.09 
 
 		 312 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  25.9 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  24.84 
 
 		 378 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  27.76 
 
 		 344 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  30.49 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  27 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  26.97 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.97 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.97 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  26.97 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  26.97 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.97 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  26.07 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  26.97 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  26.67 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  25.33 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  28.52 
 
 		 331 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  26.32 
 
 		 322 aa  89  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.09 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  24.57 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  25.66 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  27.73 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.54 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  24.31 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  24.31 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.48 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.31 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.31 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  24.31 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  26.46 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  24.31 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  27.11 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.2 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.2 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  24.31 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  27.13 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  24.75 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.63 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  25.25 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  24.31 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  24.75 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.96 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  26.39 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  24.75 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  24.75 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  24.75 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  24.74 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.14 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  26.04 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  25.64 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  24.58 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  27.04 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  23.48 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  25.27 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.78 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  22.4 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  26.38 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  25.17 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  25.17 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.03 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  25.41 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  21.34 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  23.88 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  25.53 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.22 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.55 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  26.3 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  25.16 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  24.89 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  25.11 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.7 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.78 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  27.19 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  25.81 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  27.19 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  22.48 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  24.39 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  24.41 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  22 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  25.68 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  24.2 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  21.74 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  27.24 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  24.42 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.46 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  24.09 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  25.3 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  25 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.9 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  23.68 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  25.19 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0057  band 7 protein  23.66 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  26.94 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02741  hypothetical protein  24.66 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  25.11 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06901  Band 7 protein  23.94 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>