276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0402 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  54.3 
 
 
189 aa  217  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.33 
 
 
193 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.96 
 
 
188 aa  130  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.9 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  36.76 
 
 
183 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.98 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  36.41 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
187 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  33.15 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
199 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  34.83 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  34.07 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
188 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  34.04 
 
 
190 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
188 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.88 
 
 
180 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.41 
 
 
180 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.9 
 
 
190 aa  104  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  29.79 
 
 
199 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
201 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.43 
 
 
178 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 
195 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  35.16 
 
 
183 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.18 
 
 
181 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  32.79 
 
 
181 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 
187 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.75 
 
 
183 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
187 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
187 aa  99  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  30.48 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.32 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  31.87 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.72 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  31.79 
 
 
188 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.72 
 
 
181 aa  94.4  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  33.99 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.18 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.69 
 
 
200 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.81 
 
 
194 aa  90.9  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  27.84 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.52 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.58 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  34.21 
 
 
167 aa  87.8  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
181 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.51 
 
 
176 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 
224 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  27.64 
 
 
215 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  41.75 
 
 
116 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.69 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.49 
 
 
186 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 
196 aa  85.5  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.05 
 
 
202 aa  84.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  29.41 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.46 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.89 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  26.02 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  32.21 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.96 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  28.27 
 
 
213 aa  82  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.26 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.61 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.1 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  30.27 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.25 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.28 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  26.95 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  29.23 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.28 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  29.25 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.04 
 
 
219 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.13 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>