275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0379 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0379  transposase  100 
 
 		 145 aa  302  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  48.94 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  40.58 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  42.97 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  37.41 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  39.69 
 
 		 153 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  34.78 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  34.53 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  34.85 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  32.26 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  34.96 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  33.33 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  29.55 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  32.8 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  37.23 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  30.22 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  32.82 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  31.29 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  28.81 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  30.4 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2684  transposase IS200-like  28 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  28.93 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  30.83 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  28.95 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  27.19 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  25.41 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  27.05 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3265  transposase IS200-like  25.44 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.488417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  26.02 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2962  transposase IS200-like  25.44 
 
 		 171 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.343837  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  24.59 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  29.17 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  27.97 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  26.55 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7258  transposase IS200-family protein  26.79 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  28.21 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  27.43 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  27.43 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  25.66 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  25.66 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  25.66 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  29.06 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  29.06 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  25.66 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  25.66 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  30.17 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  23.73 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  23.73 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  25.64 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  23.73 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  26.32 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  24.14 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  23.89 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  23.08 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  23.08 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1470  transposase IS200-family protein  27.96 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0631465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5282  transposase IS200-family protein  27.96 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  23.08 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  23.08 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  23.08 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  23.08 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  23.08 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  24.79 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  26.96 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  25.41 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  23.89 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  26.05 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  23.93 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  24.77 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  25.86 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  26.92 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1214  transposase IS200-family protein  25 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.0782203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>