More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1685 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  73.54 
 
 
276 aa  396  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  63.04 
 
 
276 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  60.31 
 
 
276 aa  329  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0143  prephenate dehydrogenase  62.32 
 
 
275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0125  prephenate dehydrogenase  63.04 
 
 
275 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  63.04 
 
 
275 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 
275 aa  309  4e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  52.17 
 
 
276 aa  290  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  56.88 
 
 
275 aa  289  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  38.71 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  37.28 
 
 
284 aa  195  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  40.21 
 
 
285 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 
285 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  38.4 
 
 
280 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  35.59 
 
 
279 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 
292 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 
319 aa  161  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
288 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.01 
 
 
742 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 
299 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 
364 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 
287 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.96 
 
 
300 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.47 
 
 
311 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
289 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  31.42 
 
 
294 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 
290 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 
286 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 
286 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  29.96 
 
 
292 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.82 
 
 
311 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.11 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  30.88 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  33.07 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 
293 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  31.16 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  29.24 
 
 
292 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  30 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  31.5 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.86 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 
286 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 
292 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 
367 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  31.41 
 
 
534 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 
298 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  29.45 
 
 
293 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.64 
 
 
746 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.11 
 
 
311 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 
280 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.39 
 
 
311 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  30.77 
 
 
298 aa  141  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  31.21 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  33.73 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.41 
 
 
735 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.68 
 
 
770 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.5 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 
311 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 
311 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.57 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.57 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  30.99 
 
 
369 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  32.52 
 
 
288 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  28.88 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.68 
 
 
780 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 
290 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  31.41 
 
 
535 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.41 
 
 
746 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.52 
 
 
748 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.03 
 
 
310 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 
296 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  27.04 
 
 
293 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.62 
 
 
778 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 
368 aa  135  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.05 
 
 
746 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  30.47 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  32.13 
 
 
370 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.93 
 
 
313 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.05 
 
 
746 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.24 
 
 
313 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.41 
 
 
746 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.93 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.88 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.69 
 
 
746 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  29.54 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  30 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.65 
 
 
746 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>