More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0979 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  100 
 
 		 412 aa  828    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  62.25 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  57.7 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  56.48 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  51.36 
 
 		 411 aa  423  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  49.63 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  49.39 
 
 		 415 aa  359  5e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  50.13 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  49.61 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  34.91 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  33.83 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  33.26 
 
 		 419 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  32.61 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  33.91 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  34.13 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  32.53 
 
 		 412 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 410 aa  166  9e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  31.76 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  32.3 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  32.58 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  23.66 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  23.1 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 550 aa  82.8  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 471 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  24.56 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  25.97 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  27.3 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.67 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  27.72 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2528  histidine kinase  22.75 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00877701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 536 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  26.91 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 574 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.4 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 722 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.19 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  23.74 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  26.28 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.93 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  25 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  25.58 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  24.49 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1750  histidine kinase  30.42 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  26.16 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  24.58 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  24.72 
 
 		 538 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  25.09 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  26.3 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2589  sensor histidine kinase  27.59 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.36 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  21.89 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.61 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 563 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.54 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.54 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  24.27 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  24.2 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 603 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  23.7 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  30.6 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  26.26 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  27.33 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  22.22 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  23.39 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.69 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  25.35 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3061  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  21.51 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>