More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0452 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0452  response regulator ompr  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  45.09 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1397  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1277  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112244  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0763  DNA-binding response regulator  46.22 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00370439  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1360  transcriptional regulatory protein BaeR  46.43 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1384  response regulator receiver  45.81 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  44.84 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0808  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  44.89 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000531821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0564  response regulator receiver  43.75 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.924373  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0464  DNA-binding response regulator  45.78 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316679  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0494  two-component response regulator  44.64 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0966  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  45.54 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00233107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2131  response regulator receiver  41.78 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0978  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1135  transcriptional regulatory protein BaeR  43.75 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1147  regulatory protein VanR  44.44 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 236 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.46 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2094  response regulator receiver  42.08 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.01 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  37.55 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  39.04 
 
 		 236 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  37.61 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  36.89 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  38.7 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  41.52 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  36.77 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  38.6 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  39.19 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  39.19 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 234 aa  154  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  36.32 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  35.65 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  35.65 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  37.17 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  33.78 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  33.78 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  39.55 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  35.65 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  35.65 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>